Bajo la estructura del Ministerio de Agricultura (MINAG), la Autoridad Nacional del Agua (ANA) tiene entre sus facultades el otorgamiento de derechos sobre los recursos hídricos, excepto para el caso de aguas minero-medicinales, cuyos derechos son otorgados por el Ministerio de Comercio Exterior y Turismo. Asimismo, esta institución se encarga de articular las funciones de las diversas instituciones públicas relacionadas con los recursos hídricos.